Rektor UIN K.H. Abdurrahman Wahid Pekalongan, Prof. Dr. Zaenal Mustakim, M.Ag. menyampaikan bahwa pencapaian ini merupakan hasil dari kerja keras dan kerjasama seluruh pihak, tanpa adanya sinergitas yang baik tidak mungkin hal ini dapat terwujud, “Saya bersama keluarga besar IAIN Pekalongan tentunya bersyukur dan mengucapkan terima kasih kepada semua pihak yang telah membantu proses transformasi menjadi UIN K.H Abdurrahman Wahid, khususnya kepada Bapak Presiden Republik Indonesia, Kemenpan-RB, Kementerian Sekretariat Negara, Kementerian Keuangan dan secara khusus kepada Kementerian Agama: Gus Menteri, Bapak Sekjen, Dirjen, Direktur, Kasubdit Kelembagaan, dan Biro Ortala, ungkap Rektor.
Dengan Terwujudnya IAIN Menjadi UIN Gusdur kedapanya agar lebih manambah kualitas mutu baik akademik maupun non akademik untuk menyesuaikan diri menjadi UIN K.H Abdurrahman Wahid Pekalongan